根據財政部１１３１１０１台財稅字第１１３０４５５３７００號令，放寬企業營所稅適用盈虧互抵的「如期申報」條件，當營利事業逾期繳稅，但尚未達到加徵滯納金規定（即逾期繳稅三天內），可視為如期申報，仍可適用盈虧互抵。
財政部表示針對所得稅法第39條規定，如果營利事業”會計帳冊簿據完備”，且採用”藍色申報書”或是”委託會計師簽證”，且如期申報者，當年度核定虧損可以從以後10年內純益額中扣除。而何謂「如期申報」實務認定上常出現爭議，稽徵機關認為「報繳合一」原則下，如期申報應包含自行繳納結算稅額。財政部新發布函釋放寬規定，逾期繳納應納稅額但未達加徵滯納金規定者（目前為每逾三日按滯納數額加徵1%滯納金），可視為情節輕微，仍符「如期申報」要件。
相關法令規定請參考以下內容
財政部１１３１１０１台財稅字第１１３０４５５３７００號令
營利事業逾期繳納應納稅額情節輕微適用盈虧互抵規定
一、依所得稅法第71條第1項、第75條第1項與第2項及第76條第1項規定，營利事業應於每年所得稅結算申報期限內，遇有解散、廢止、合併或轉讓情事時，應於當期決算申報或清算申報期限內，依規定辦理相關所得稅申報，計算其應納稅額，於申報前自行繳納，並檢附自繳稅款繳款書收據依限辦理所得稅申報。爰營利事業使用藍色申報書或委託會計師查核簽證，應依上開各規定於法定申報期間內自行繳納應納稅額，並辦理所得稅申報，始符合所得稅法第39條第1項但書盈虧互抵規定「如期申報」要件。
二、營利事業逾期繳納上開申報應自行繳納稅額，惟未符合稅捐稽徵法第20條第1項應加徵滯納金規定者，得視為情節輕微，仍符合「如期申報」及「使用藍色申報書或經會計師查核簽證」要件可依所得稅法第39條第1項但書規定適用盈虧互抵。
所得稅法第 39 條
以往年度營業之虧損，不得列入本年度計算。但公司組織之營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用第七十七條所稱藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經該管稽徵機關核定之前十年內各期虧損，自本年純益額中扣除後，再行核課。
本法中華民國九十八年一月六日修正之條文施行前，符合前項但書規定之公司組織營利事業，經稽徵機關核定之以前年度虧損，尚未依法扣除完畢者，於修正施行後，適用修正後之規定。